#نظر تکمیلی
... پی بردن و تعیین ساختار سه‌بعدی مولکولها به ویژه پروتئین‌ها داستان طولانی داره و برای یافتن ساختار یک پروتئین مثل میوگلوبین توسط اشعه ایکس در دهه ۴۰ و ۵۰ میلادی دو تا از خبره‌ترین بیوشیمدانان جهان «ماکس پروتز» و «جان کندرو» سالها وقت صرف کردند تا در نهایت ساخت یک پروتئین رو پیدا کردند و برای این کار جایزه نوبل ۱۹۶۲ رو گرفتند.
وقتی اولین بار پایگاهی برای ذخیره ساختار سه بعدی پروتئین به اسم PDB راه اندازی شد فقط ساختار تعداد انگشت شماری پروتئین داشت چون تعیین توالی و بعد تعیین ساختار سه بعدی پروتیئنها چون با اشعه ایکس و حتی اخیرا با NMR بسیار پیچیده، هزینه بر و زمانبر بود؛ ولی الان به لطف روشهای محاسباتی این ساختارها به چندصدهزار پروتیئن در پایگاههایی مثل RCSB PDB و swiis prot و uniport رسیده.
هیجان انگیزین قسمتش اینه که نه فقط ساختار سه بعدی رو پیش‌بینی می‌کنند بلکه توانایی دستکاری پروتئینهای موجود و حتی طراحی پروتئینهای که اصلا در طبیعت وجود ندارند رو هم فراهم کردند که از اون به اسم protein design یاد می‌شه. بخصوص پس از توسعه AlphaFold software که جایزه نوبل رو هم برای jumper به همراه آورد عملا قدرت هوش مصنوعی در پیش بینی این ساختارها با کمترین خطا نشان داده شد و حالا هم ساخت آنتی بادی خنثی کننده برای چنین ساختار سمی پیچیده‌ایی که متضمن بررسی n کونفورماسیون مختلف و سنجیدن کارآیی تک‌تک اونا در ازمایشگاه که عملا غیرممکن است؛ تنها با محاسبه و کامپیوتر، واقعا تحولی بزرگی برای بیوشیمی و پزشکی و داروسازی محسوب می‌شه و شاید تحسین و تمجید اون با عنوان Groundbreaking اغراق آمیز نباشه.
@FarazTed
... پی بردن و تعیین ساختار سه‌بعدی مولکولها به ویژه پروتئین‌ها داستان طولانی داره و برای یافتن ساختار یک پروتئین مثل میوگلوبین توسط اشعه ایکس در دهه ۴۰ و ۵۰ میلادی دو تا از خبره‌ترین بیوشیمدانان جهان «ماکس پروتز» و «جان کندرو» سالها وقت صرف کردند تا در نهایت ساخت یک پروتئین رو پیدا کردند و برای این کار جایزه نوبل ۱۹۶۲ رو گرفتند.
وقتی اولین بار پایگاهی برای ذخیره ساختار سه بعدی پروتئین به اسم PDB راه اندازی شد فقط ساختار تعداد انگشت شماری پروتئین داشت چون تعیین توالی و بعد تعیین ساختار سه بعدی پروتیئنها چون با اشعه ایکس و حتی اخیرا با NMR بسیار پیچیده، هزینه بر و زمانبر بود؛ ولی الان به لطف روشهای محاسباتی این ساختارها به چندصدهزار پروتیئن در پایگاههایی مثل RCSB PDB و swiis prot و uniport رسیده.
هیجان انگیزین قسمتش اینه که نه فقط ساختار سه بعدی رو پیش‌بینی می‌کنند بلکه توانایی دستکاری پروتئینهای موجود و حتی طراحی پروتئینهای که اصلا در طبیعت وجود ندارند رو هم فراهم کردند که از اون به اسم protein design یاد می‌شه. بخصوص پس از توسعه AlphaFold software که جایزه نوبل رو هم برای jumper به همراه آورد عملا قدرت هوش مصنوعی در پیش بینی این ساختارها با کمترین خطا نشان داده شد و حالا هم ساخت آنتی بادی خنثی کننده برای چنین ساختار سمی پیچیده‌ایی که متضمن بررسی n کونفورماسیون مختلف و سنجیدن کارآیی تک‌تک اونا در ازمایشگاه که عملا غیرممکن است؛ تنها با محاسبه و کامپیوتر، واقعا تحولی بزرگی برای بیوشیمی و پزشکی و داروسازی محسوب می‌شه و شاید تحسین و تمجید اون با عنوان Groundbreaking اغراق آمیز نباشه.
@FarazTed