آموزش بیوانفورماتیک کاربردی

بخش آشنایی با پایگاه های داده های زیستی- جستجوی مقالات
ویدئوی آموزش جستجوی مقاله در پایگاه داده wiley به زبان فارسی: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/65

ویدئوی آموزش جستجوی مقاله در پایگاه داده pubmed به زبان فارسی: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/66

ویدئوی آموزش جستجوی مقاله در پایگاه داده science direct به زبان فارسی: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/67

ویدئوی آموزش جستجوی مقاله در پایگاه داده scopus به زبان فارسی: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/68

آموزش جستجوی مقاله در پایگاه داده pubmed: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/72

آموزش جستجوی مقاله در پایگاه داده PMC: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/70

آموزش جستجوی مقاله در پایگاه داده pubmed: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/73

آموزش جستجوی مقاله در چندیدن پایگاه داده مربوط به پایگاه NCBI: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/74

آموزش جستجوی مقاله در پایگاه داده pubmed: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/75

آموزش جستجوی مقاله در پایگاه داده pubmed: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/76

آشنایی با ابزارهاي سايت pubmed: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/77

آموزش جستجوی مقاله در پایگاه داده pubmed: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/78

آموزش جستجوی مقاله در پایگاه داده pubmed: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/79

آموزش جستجوی مقاله در پایگاه داده pubmed به صورت پاورپوینت: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/80

آموزش جستجوی مقاله در پایگاه داده pubmed به صورت پاورپوینت: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/81





بخش آشنایی با بلاست blast
ویدئوی آموزش نحوه بلاست کردن توالی ها در سایت NCBI به زبان فارسی: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/83

ویدئوی آموزش بلاست به زبان انگلیسی: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/84

فایل آموزش BLAST: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/85

فایل آموزش همردیفی توالی ها و BLAST: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/86

پاور پوینت اموزش بلاست: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/87






بخش آشنایی با طراحی پرایمر
فیلم اموزش مقدمات طراحی پرایمر به زبان فارسی: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/103

فایل آموزشی ابزارهاي بيوانفورماتيك و راهنماي طراحي پرايمر در تكنيكهاي مبتني بر PC: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/104

فایل آموزش در مورد مقدمات طراحی پرایمر: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/106

آموزش نرم افزار oligo 7 در طراحی پرایمر به زبان انگلیسی: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/107

پاور پوینت آموزش نرم افزار oligo 7 در طراحی پرایمر به زبان انگلیسی: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/108

فیلم نحوه نصب نرم افزار oligo 7 به زبان فارسی: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/109

دانلود نرم افزار oligo 7: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/110

دانلود فعال ساز نرم افزار oligo 7.: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/111

آموزش کامل طراحی پرایمر توسط نرم افزار oligo 7: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/112

آموزش کامل طراحی پرایمر توسط نرم افزارهای oligo 7 ، primer3 و سایت ncbi به همراه بررسی کیفیت پرایمرهای طراحی شده. فایل آموزش فوق توسط گروه پیشگامان بیوانفورماتیک آماده گردیده است و علاوه بر آموزش کامل طراحی پرایمر توسط این نرم افزار نحوه یافتن توالی ژن مورد نظر جهت طراحی پرایمر نیز ذکر شده است: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/114






بخش آشنایی با عملکرد دومین های پروتئین ها
فایل آموزشی آشنایی با پایگاه های ثانویه داده پروتئین: مانند نواحی دومین و عملکردی پروتئین ها: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/54

آشنایی با پایگاه های ثانویه ارائه کننده داده های مربوط به پروتئین ها: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/88

فایل آشنایی با اصول پروتئوميكس: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/89

آشنایی با پایگاه داده ارائه دهنده ساختار سه بعدی پروتئین ها: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/90

آشنایی با نرم افزار مشاهده ساختار سه بعدی پروتئین ها: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/91

آشنایی با نقشه پروتئینی: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/92

برای سهولت در استفاده از مطالب آموزشی کانال و جلوگیری از سردرگمی، هر بخش آموزشی را به صورت جداگانه فهرست و لینک هر قسمت را ارائه نموده ایم. توصیه میگردد مطالعه بخش ها به ترتیب ارائه شده انجام گیرد. فایل های آموزشی ارائه شده ( به جز آنها که توسط گروه به صورت اختصاصی تهیه میگردد) از منابع مختلف جمع اوری شده است و جهت رعایت حق کپی در فایل ها اموزشی هیچ گونه تغییری ایجاد ننموده ایم. کارشناسان کانال بعد از مطالعه این فایل ها نسبت به رفع کاستی ها این فایل های اموزشی و ارائه آموزشی جامع و کاربردی اقدام نموده اند. به عنوان مثال ما در بخش "آشنایی با پایگاه های داده های زیستی" فایل های آموزشی متعددی در مورد راهنمای جستجوی مقالات قرار داده ایم، اما در هیچ فایل آموزشی، کاربرد مقالات در نوشتن مقالات متاانالیز (مقالاتی که براساس آنالیز نتایج سایر مقالات نوشته می شوند) عنوان نشده است. برای رفع این کاستی گروه، آموزشی را در جهت آنالیز داده های مقالات جستجو شده و نوشتن مقالات متاانالیز ارائه خواهد داد. یا در مثال دیگر در بخش بلاست فایل های آموزشی متعددی ارائه شده اما آموزشی که توسط گروه ارائه خواهد شد مبتنی بر کاربردهای تکنیک بلاست مانند کشف ژن ها در گونه های مختلف خواهد بود.

بخش های آموزشی که تا کنون در کانال قرار گرفته است

بخش اول: معرفی بخش های آموزشی و سرفصل های هر بخش: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/21

بخش بیوانفورماتیک چیست؟
فایل اموزشی نگاهی به بیوانفورماتیک: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/39

فایل راهنمای عملی و نظری بیوانفورماتیک: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/40

آشنایی با اهمیت بیوانفورماتیک: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/44

فایل آموزشی آشنایی با بيوانفورماتيك و كتا بهاي مربوط به آن و آشنايي با دوره هاي دانشگاهي بيوانفورماتيك: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/42

فایل آموزشی آشنایی با اهداف بيوانفورماتيك ،دادهها و سازمان دهي دادهها در پايگاه داده ها و همچنين اعمال و روشهاي محاسباتي : https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/43

فایل آموزشی مقدمه ای بر بیوانفورماتیک بخش پروتئوميكس و ژنوميكس: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/41

مقدمه اي بر بيوتكنولوژي: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/45

فایل آشنایی با ژنومیکس: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/46

فایل آموزشی مروري بر ژنتيک مولکولي(زیست مولکولی): https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/47

دانلود پاورپوینت آشنایی با بیوانفورماتیک به زبان فارسی: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/48



بخش آشنایی با پایگاه های داده های زیستی
آشنایی با پایگاه های داده اولیه: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/52

فایل آموزشی آشنایی با پایگاه های داده اولیه به قالب پاور پوینت: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/53


ویدئوی اموزش سایت NCBI به زبان فارسی: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/57

آموزش سایت ncbi: موتور جست و جوي Entrez: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/61

آموزش سایت ncbi:نحوه به دست آوردم توالي هاي نوکلئوتيدي، ژن ها و پروتئين ها: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/59

دانلود فایل ویدئویی مربوط به یادگیری بخش ژن سایت NCBIبه زبان فارسی: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/58

آموزش سایت ncbi: آشنایی با کتاب هاي مرجع در NCBI: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/60

آموزش سایت ncbi: آموزش بانك واژگان: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/64

آموزش سایت ncbi: آموزش map viewer: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/62

آموزش سایت ncbi: آموزش map viewer: https://telegram.me/pishgam_bioinformatics/63

🔵آموزش های جامع و اختصاصی سایت پیشگامان بیوانفورماتیک ( به زبان فارسی)

🔵بخش طراحی پرایمر

❇️فیلم آموزش جامع طراحی پرایمر برای میکروارناها (miRNA) به زبان فارسی

❇️فیلم آموزش جامع طراحی پرایمر برای آرناهای حلقوی (circRNA) به زبان فارسی

❇️فیلم آموزش جامع طراحی پرایمر برای توالی یابی ژن ها و بررسی خودکار وجود جهش ها بر روی توالی ها

❇️فیلم آموزش جامع طراحی پرایمر برای بررسی متیلاسیون در ژن ها به زبان فارسی

❇️فیلم آموزش طراحی پرایمر اختصاصی برای ریل تایم real time pcr (روش سایبر گرین) به زبان فارسی

❇️طراحی پرایمر برای کلونینگ: فیلم آموزش جامع نرم‌افزار SnapGene



🔵بخش آنالیز دادههای ریل تایم (real time PCR)


❇️فیلم آموزش آنالیز بیومارکری و محاسبه پارامترهای آماری برای تغییرات بیان ژن ها-بخش دوم

❇️فیلم آموزش آنالیز دادههای ریل تایم (real time pcr) با استفاده از نرم افزارهای REST، SPSS ، graphpad و رسم نمودار به زبان فارسی

❇️فیلم آموزش ترسیم منحنی راک (Roc) و محاسبه پارامترهای آماری برای تغییرات بیان ژن ها به عنوان نشانگرهای زیستی

❇️فیلم فارسی آموزش محاسبه کارایی PCR و پرایمرها ( PCR Efficiency) در ریل تایم با نرم افزار LinRegPCR


🔵بخش آنالیز دادههای میکرواری (microarray)

❇️فیلم فارسی آموزش آنالیز داده های میکرواری با استفاده از نرم افزار R بخش اول: آشنایی با پایگاه داده GEO و آموزش نرم افزار GEO2R

❇️فیلم فارسی آموزش آنالیز داده های میکرواری با استفاده از نرم افزار R بخش دوم: آموزش نرم افزار R به صورت مرحله به مرحله و با رویکرد آنالیز داده های میکرواری

❇️فیلم فارسی آموزش آنالیز داده های میکرواری با استفاده از نرم افزار R بخش سوم: آموزش آنالیز داده های میکرواری نوع Affymetrix

❇️فیلم فارسی آموزش آنالیز داده های میکرواری با استفاده از نرم افزار R بخش چهارم: آموزش آنالیز داده های میکرواری تک کاناله و دو کاناله نوع Agilent

❇️فیلم فارسی آموزش آنالیز داده های میکرواری با استفاده از نرم افزار R بخش پنجم: رسم نمودار با استفاده از نرم افزار R (هیتمپ ، volcano و ....)



🔵آنالیز سایر تکنیک های زیستی

❇️آموزش آنالیز آماری پلی مورفیسم ها در مطالعات همبستگی موردی-شاهدی (case control) به همراه فیلم آموزشی به زبان فارسی

❇️فیلم آموزش آنالیز آماری داده های MTT با استفاده از نرم افزارهای گراف پد پریسم و SPSS و محاسبه پارامترهای مربوطه مانند IC50 ، به زبان فارسی

❇️فیلم آموزش آنالیز دادههای الایزا برای سنجش سطح پروتیئن و متابولیت ها-آنالیز اماری و رسم نمودار

❇️فیلم آموزش آنالیز و تفسیر وسترن بلات (Western blot) برای بررسی تغییرات سطح پروتئین ها بین گروه ها - آنالیز آماری و ترسیم نمودار

❇️فیلم آموزش جامع آنالیز دادههای فلوسایتومتری با نرم افزار فلوجو (flowjo) به زبان فارسی

🔵برای مشاهده جزئیات هر آموزش بر روی لینک مربوطه کلیک نمایید.

.